Desde que finalizó sus estudios de Medicina en 1983 e inició su especialización en Oncología Radioterápica, Markus Notter ha participado activamente ya desde 1984 en la concepción y creación de la hipertermia superficial y, a partir de 1987, de la hipertermia profunda en el hospital cantonal de Aarau (Suiza). De esta época proceden ya publicaciones y comunicados sobre los primeros resultados satisfactorios de la combinación de hipertermia y radioterapia, que él mismo consiguió en colaboración con el Dr. N. Schwegler, su impulsor y jefe médico. Tras ser ascendido a director médico y vicejefe médico en 1999, Markus Notter permaneció en el hospital cantonal de Aarau hasta principios de 2005, cuando ocupó la dirección de la unidad de Oncología Radioterápica del hospital del cantón de Neuchâtel de La Chaux-de-Fonds (Suiza), donde dio continuidad casi de inmediato a la terapia de hipertermia superficial con microondas. En 2009 desarrolló la idea de la hipertermia superficial infrarroja controlada por termografía para responder mejor a los retos planteados por las recidivas extendidas de tumores de la pared torácica. Desde junio de 2015 trabaja en el equipo de Oncología Radioterápica del Lindenhofspital de Berna. Como es natural, Notter participa en este hospital en el desarrollo de la hipertermia. Los logros conseguidos en radioterapia hipofraccionada de dosis bajas combinada con la hipotermia inducida por radiación infrarroja filtrada por agua han convertido al departamento en un «centro de referencia» de esta aplicación, sobre todo en el cáncer de mama no operable recurrente localizado o ya tratado con radioterapia intensiva que ha desarrollado resistencia a la medicación antihormonal, la quimioterapia o la inmunoterapia.